Cancéropôle Ile-de-France
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11 vidéos sélectionnées
Formation NGS & Cancer : Introduction à Galaxy
Tutoriel de présentation de l'outil Galaxy utilisé dans notre formation NGS & Cancer.
Formateur : M'Boyba Diop, Institut Gustave Roussy.
Vidéo réalisée dans le cadre de la formation en bio-informatique "NGS et cancer" du Cancéropôle Île-de-France.
Le Cancéropôle Île-de-France a mis en place un groupe de travail "bio-informatique et cancer" qui réunit des chercheurs des institutions franciliennes impliquées dans ce domaine. Les réflexions de ce groupe de travail ont conduit à...
Thèmes liés : formation informatique en ile de france
Utilisation de cBioPortal pour les analyses NGS
Tutoriel de présentation de l'outil en ligne cBioPortal, qui permet d'explorer, visualiser et analyser des données de génomiques de type ADN, ARN, protéines, qui proviennent de multiples études dont les données ont été mis à disposition de la communauté scientifique.
Formateur : Marc Deloger, Institut Curie, Inserm U900, Mines ParisTech.
Vidéo réalisée dans le cadre de la formation en bio-informatique "NGS et cancer" du Cancéropôle Île-de-France.
Accéder à l'outil :...
Thèmes liés : formation informatique en ile de france
Formation NGS : Exome-Seq, altérations du nombre de copies avec Galaxy
Tutoriel Galaxy pour la réalisation de l'analyse d'un exome complet d'un couple échantillon tumoral / constitutionnel, et détection des altérations du nombre de copies.
Formateur : Elodie Girard, Institut Curie, INSERM U900, Mines ParisTech.
Vidéo réalisée dans le cadre de la formation en bio-informatique "NGS et cancer" du Cancéropôle Île-de-France.
Données tests utilisées dans ce tutoriel disponibles sur notre site web : http://www.canceropole-idf.fr/fr/ngs
Le Cancéropôle...
Thèmes liés : formation informatique en ile de france
Formation NGS : Exome-Seq, détection de variants avec Galaxy
Tutoriel Galaxy pour la réalisation de l'analyse d'un exome complet et la détection de variants.
Formateur : Elodie Girard et Romain Daveau, Institut Curie, INSERM U900, Mines ParisTech.
Vidéo réalisée dans le cadre de la formation en bio-informatique "NGS et cancer" du Cancéropôle Île-de-France.
Données tests utilisées dans ce tutoriel disponibles sur notre site web : http://www.canceropole-idf.fr/fr/ngs
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Formation NGS : Analyse de génome: détection de variants structuraux
Tutoriel Galaxy pour la réalisation de l'analyse d'un génome complet et la détection de variants structuraux sous Galaxy.
Formateur : Bruno Zeitouni, Institut Curie.
Vidéo réalisée dans le cadre de la formation en bio-informatique "NGS et cancer" du Cancéropôle Île-de-France.
Données tests utilisées dans ce tutoriel disponibles sur notre site web : http://www.canceropole-idf.fr/fr/ngs
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Formation NGS : Analyse de l'expression différentielle à partir de données RNA-Seq
Tutoriel Galaxy pour la réalisation de l'analyse de l'expression différentielle à partir de données RNA-Seq avec Galaxy.
Formateurs : Coline Billeret, CNRS, Université Paris Sud.
Vidéo réalisée dans le cadre de la formation en bio-informatique "NGS et cancer" du Cancéropôle Île-de-France.
Données tests utilisées dans ce tutoriel disponibles sur notre site web : http://www.canceropole-idf.fr/fr/ngs
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Formation NGS : Analyse de données ChIP-Seq avec Galaxy
Tutoriel Galaxy pour la réalisation d'une analyse de données ChIP-Seq.
Formateur : Jean-Charles Cadoret, Université Paris Diderot.
Vidéo réalisée dans le cadre de la formation en bio-informatique "NGS et cancer" du Cancéropôle Île-de-France.
Données tests utilisées dans ce tutoriel disponibles sur notre site web : http://www.canceropole-idf.fr/fr/ngs
Le Cancéropôle Île-de-France a mis en place un groupe de travail "bio-informatique et cancer" qui réunit des chercheurs des...
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Formation NGS : Identification des transcrits de fusion à partir de données RNA-Seq
Tutoriel Galaxy pour la réalisation de l'identification des transcrits de fusion à partir de données RNA-Seq avec Galaxy.
Formateurs : M'Boyba Diop et Marc Deloger, Gustave Roussy.
Vidéo réalisée dans le cadre de la formation en bio-informatique "NGS et cancer" du Cancéropôle Île-de-France.
Données tests utilisées dans ce tutoriel disponibles sur notre site web : http://www.canceropole-idf.fr/fr/ngs
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Formation NGS: Visualisation de données génomiques par UCSC Genome Browser
Tutoriel Galaxy pour la visualisation de données génomiques par utilisation du Genome Browser UCSC.
Formateur : Yannick Boursin, Institut Gustave Roussy.
Vidéo réalisée dans le cadre de la formation en bio-informatique "NGS et cancer" du Cancéropôle Île-de-France.
Données tests utilisées dans ce tutoriel disponibles sur notre site web : http://www.canceropole-idf.fr/fr/ngs
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Formation NGS: Visualisation de données génomiques par IGV (Integrated Genome Viewer)
Tutoriel Galaxy pour la visualisation de données génomiques par utilisation du Genome Browser IGV (Integrated Genome Viewer).
Formateur : Yannick Boursin, Institut Gustave Roussy.
Vidéo réalisée dans le cadre de la formation en bio-informatique "NGS et cancer" du Cancéropôle Île-de-France.
Données tests utilisées dans ce tutoriel disponibles sur notre site web : http://www.canceropole-idf.fr/fr/ngs
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